部分藏区公民发生犯罪案件，当地司法机关一般参照当地民族习惯法处理。如青海藏族地区的杀人案件，当地习惯法是以赔命价的方法处罚犯罪。这种习惯法在本地区一直盛行。在当地司法机关对犯人判刑后，还必须赔偿命价，只有赔偿命价以后，才能尽弃前嫌，重归于好，否则被害人亲属必欲兴师动众实行复仇。

       为避免伤害案件再度发生，藏地司法机关摸索出了一些经验，“行之有效的办法是，按照法律处理命案的同时，由法院或政府出面，会同民族、宗教上层人士，予以调处。对被害人的损失，以当地中等人家财产的一半为标准进行赔偿”。

       如1988年，青海省同仁县瓜什则乡牧民与循化县岗查乡牧民因草山纠纷，几次发生械斗事件。1990年初，青海人民政府调查裁定了这一由来已久的双边草山纠纷。文件下发后，双方群众一致要求政府派赛仓活佛和叶雄活佛参与处理双边草山纠纷遗留的处罚赔偿等各种问题。为妥善解决双边草山纠纷遗留问题，消除隔阂，稳定双边的局势，两位活佛在政府的授权下，会同当地公安机关和群众代表对械斗中人员死亡问题和赔偿标准在《刑法》原则范围内作了协商，最后妥善解决了问题，维护了地方治安的稳定。